Среди пользователей СФ-56: Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, ФГБУ «Россельхозцентр», ИХС РАН, ИОХ РАН, Иркутский авиационный завод, РФЯЦ-ВНИИЭФ, Институт микробиологии РАН, Санкт-Петербургская химико-фармацевтическая академия и другие.